Na área de Defesa, a Omnisys é tradicional parceira do Instituto de Pesquisas da Marinha – IPqM e se destaca como único fornecedor nacional capacitado no desenvolvimento e fabricação de Sistemas de Guerra Eletrônica, na modalidade de não-comunicações.

A empresa fornece equipamentos de Contramedidas Eletrônicas (CME) que opera nas corvetas brasileiras da classe Inhaúma. O CME executa funções de despistamento de radares de mísseis e de direção de tiro, pertencentes a plataformas inimigas.

Consolidando sua atuação nessa área, a Omnisys foi contratada pela Marinha do Brasil para fabricar e fornecer um equipamento MAGE (Medidas de Apoio à Guerra Eletrônica) para as mesmas corvetas da classe Inhaúma. É um equipamento de detecção, identificação e classificação de sinais de radar, assim como sua localização e provável plataforma de origem.

A Omnisys também realiza a instalação, integração e testes no porto (TAP) e no mar (TAM) dos equipamentos fabricados, assim como provê o treinamento de operação e manutenção das equipes técnicas da Marinha.